卵巢囊肿的治疗方式取决于它的性质，一般来说，如果囊肿直径小于5厘米，又没有确切根据证明是肿瘤的话，这种多为功能性囊肿，可以随时注意变化，两到三个月检查一次，再根据情况调整检查间隔时间，日常养成良好的生活习惯和饮食习惯;如果囊肿直径大于5厘米，则多为卵巢囊肿，一般需要进行手术治疗
一、饮食疗法
有的患者治疗卵巢囊肿之后一直不见完全康复，主要是由于人的体液是酸化的，酸性体液不改变，囊肿就不会完全消除掉，要彻底治愈卵巢囊肿的话，就要改善酸性体质，多吃碱性食物，同时多补充身体所需的营养物质，这样才能有效消灭体内的变异细胞，恢复自身免疫力。
二、卵巢囊肿患者吃什么好
卵巢囊肿患者日常应该坚持低脂肪饮食并保证足够的营养，瘦肉、鸡肉、鸡蛋、鹌鹑蛋、豆腐等高蛋白、低脂肪、低胆固醇食物是不错的选择；
吃甲鱼、海带、紫菜、牡蛎等海产品可凉血活血、软坚散结，促进囊肿的吸收；
吃富含纤维素、微量元素及维生素类食品，如白菜、芦笋、芹菜、菠菜、黄瓜、冬瓜、水果等，增强抗病能力。
三、卵巢囊肿切除术
如果是良性囊肿的话，年轻患者尤其是绝经前患者多采用卵巢囊肿切除术，而且会尽可能保留正常的卵巢组织
四、输卵管卵巢切除术
年龄较大的患者，或绝经后的患者，可以进行一侧或双侧输卵管卵巢切除术，切除的时候应该以完整切除为宜，术中要注意腹压快速变化引起患者脉搏、呼吸、血压的变动，必要时加速输液或输血，输氧，更要预防早期发现急性胃扩张，麻痹性肠梗阻以及由此而引起的水，电解质平衡失调等。
五、恶性卵巢囊肿手术治疗
如果卵巢囊肿已经接近晚期，就要尽可能切除原发囊肿及所能见到的盆腔、腹腔转移灶。由于卵巢恶性囊肿常与子宫，附件粘连或浸润且紧贴盆腹膜，因此现在多采取卷地毯式将子宫与肿瘤连同盆腹膜整块切除，如大网膜切除，部分肠切除，部分膀胱，输尿管切除。
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